青海大学医学部中医系成立于1971年11月，当年开始招收中医学本科专业，1998年在中医学专业下开设中西医临床医学专业方向，2006年经青海省教育厅批准设立了中医学专业中医骨伤、全科医学两个专业方向。2000年获批中西医结合临床硕士学位点。2002年获批外国留学生培养点。2012年获批青海省中医药重点实验室。2015年获批中医专业硕士学位点。2015年获批卓越医生（中医）教育培养计划改革试点高校，同时获批“面向基层的中医全科医学人才培养模式改革”试点项目。2019年入选省级一流本科专业建设点。2019年获批国家中医药管理局中医药高层次人才培养基地。2020年获批青海省糖脂代谢疾病防控中医药重点实验室。2021年获批中医学一级学科博士点，中医学、中西医结合一级学科硕士点。2022年入选国家级一流本科专业建设点。2023年通过教育部中医学专业认证。

现有中医学、针灸推拿学、康复治疗学三个本科专业，年招生规模80人左右，在校生494人。有中医学一级学科博士点1个，在校生22人。有中医学、中西医结合2个一级学科硕士点，在校生31人。有中医专业学位硕士点1个，在校生99人。

现有教职工27名，专任教师24人，其中教授7名，副教授9名。博士6名。硕士研究生导师10名，中医药高等学校国家级教学名师1人，全国中医优秀人才3人，全国中医药创新骨干人才3人，青海省昆仑英才领军人才2人，青海省昆仑英才拔尖人才5人，青海省骨干教师1人。近五年，多名青年教师先后斩获国家级、省级教学竞赛一、二等奖。

现有青海省中医药重点实验室、青海省糖脂代谢疾病防控中医药重点实验室2个省级重点实验室。近五年，获批国家级、省部级项目10余项，在高原低氧中医药干预领域开展了系列研究工作，取得显著成效。(注：以上数据截止时间为2024年3月)